소녀 괴수 캐러멜리제

쿠로에는 어릴 때부터 몸 일부가 갑자기 흉측하게 변하는 정체불명의 증상에 시달려 왔다. '이런 날 받아 줄 사람은 없어!'라며 누구와도 어울리지 않고 지낸 쿠로에. 그러나 학교 제일의 인기남인 미나미 아라타가 그녀에게 말을 건다.

감정의 급격한 변화로 괴수 '하루곤'으로 변한 쿠로에. 아라타를 마음에 두었지만, 미소녀 마나츠가 나타나며 마음을 접는다. 이제 다시는 이런 감정을 느끼지 않을 테니 또다시 괴수가 되지 않을 거라고 생각했지만 그날 밤, 새로운 괴…

아라타의 권유로 꿈꾸던 도쿄 데스티니 랜드에서 첫 데이트를 하게 된 쿠로에. 괴수로 변해 꿈의 나라를 파괴하지 않도록 쿠로에는 만반의 준비를 한다. 하지만 그 행동이 오히려 화근이 되어 아라타와 마음이 엇갈리고 만다.

헤비메탈 페스티벌에서 아르바이트 중인 아라타와 맞닥뜨린 쿠로에. 쿠로에와 함께 있던 코타로는 아라타를 경계한다. 한편 아라타는 코타로와 함께 있는 쿠로에가 즐거워 보이자 마음이 복잡해지고...

고등학교 2학년 새 학기. 쿠로에는 아라타가 놀림거리가 되지 않도록 그를 모른척 하려고 한다. 용기를 내 한 걸음 다가가지만, 갸루 인플루언서 라이리로 활동 중인 라이무에게 눈에 띄고 마는데...

라이무의 과거와 꿈을 알게 되고, '나도 열심히 해야겠다'라고 용기를 얻은 쿠로에. 현장 학습 중 아라타와 살짝 좋은 분위기가 되지만 부끄럽기만 하다. 그러던 중, 라이무는 과거에 짝사랑했던 오카다와 마주친다.

하루곤과 키스하는 영상이 퍼지고 '괴수 왕자'라 불리며 주목받는 아라타. 소란이 잦아들기까지 쿠로에와 거리를 두려고 하지만 보고 싶은 마음은 참을 수 없다. 그런 아라타가 생각해 낸 작전은?

하루곤을 무척 좋아하는 마나츠. 그러나 아직 하루곤은 마음을 알아주지 않는다. 생각해 보니 하루곤에게 아직 좋아한다는 말을 하지 않았다는 사실을 깨달은 마나츠는 쿠로에와 라이무에게 괴수 전설로 유명한 섬에 가자고 한다.

TV 출연으로 점점 인기가 높아지는 아라타. 쿠로에와의 시간을 되찾고 싶다는 아라타의 마음은 이해하면서도 쿠로에는 마음이 복잡하고 불안하다. 그 무렵, 린코는 어느 섬을 찾아가는데...

다이치에게 괴수인 것을 들킨 쿠로에. 세상에 알려지기 전에 어떻게든 해야겠다고 고민하던 중 초등학생과 옥신각신하는 다이치를 발견한다. 아이를 상대로 어른스럽지 못하다며 말리러 나서지만, 아무래도 뭔가 오해가 있는 듯한데...

도쿄에 아카에가 출현했다. 아무래도 쿠로에를 노리는 듯하다. 그러나 쿠로에는 아라타와 세이나의 친근한 광경이 머릿속에 스쳐 괴수로 변하지 못한다. 한편, 아라타는 쿠로에를 찾아 불타는 도쿄를 뛰어다닌다.

아카에의 빔을 맞은 하루곤은 완전히 움직임을 멈춘다. 그러나 아카에는 계속해 날뛰며 도쿄 거리를 파괴해 간다. 사람들이 절망에 빠진 그때, 아라타는 홀로 하루곤의 등에 기어오르기 시작하는데...